Il DEIB aderisce a numerose associazioni e reti di cooperazione europee e internazionali, per consolidare e rafforzare le proprie attività di ricerca e le iniziative in ambito strategico, didattico e di sviluppo tecnologico:

• Informatics Europe 
• Eclipse Foundation
• ONF - Open Networking Foundation
• ELIXIR-IIB (Infrastruttura Italiana di Bioinformatica)